Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lef1P27782 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lef1P27782 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lef1P27782 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lef1P27782 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms