Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms