Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChgaP26339 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChgaP26339 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChgaP26339 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChgaP26339 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ChgaP26339 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ChgaP26339 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChgaP26339 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms