Protein–RNA interactions for Protein: P25976

Ubtf, Nucleolar transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbtfP25976 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UbtfP25976 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UbtfP25976 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UbtfP25976 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UbtfP25976 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UbtfP25976 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms