Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms