Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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PdgfaP20033 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PdgfaP20033 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PdgfaP20033 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PdgfaP20033 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PdgfaP20033 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PdgfaP20033 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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