Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NefhP19246 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NefhP19246 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NefhP19246 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NefhP19246 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NefhP19246 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NefhP19246 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NefhP19246 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NefhP19246 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NefhP19246 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NefhP19246 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NefhP19246 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NefhP19246 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NefhP19246 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NefhP19246 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NefhP19246 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NefhP19246 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NefhP19246 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NefhP19246 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NefhP19246 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NefhP19246 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NefhP19246 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NefhP19246 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NefhP19246 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NefhP19246 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NefhP19246 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NefhP19246 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NefhP19246 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NefhP19246 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NefhP19246 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NefhP19246 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NefhP19246 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms