Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms