Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpraP18052 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpraP18052 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpraP18052 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PtpraP18052 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PtpraP18052 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpraP18052 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms