Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms