Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rag1P15919 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms