Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PrphP15331 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrphP15331 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrphP15331 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrphP15331 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrphP15331 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrphP15331 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrphP15331 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrphP15331 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrphP15331 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrphP15331 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrphP15331 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrphP15331 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrphP15331 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrphP15331 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrphP15331 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrphP15331 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms