Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP11369 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP11369 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms