Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms