Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms