Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spta1P08032 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spta1P08032 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spta1P08032 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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