Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01727 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01727 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
P01727 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
P01727 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
P01727 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
P01727 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
P01727 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
P01727 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01727 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms