Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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