Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CcnkO88874 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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