Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ClppO88696 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClppO88696 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClppO88696 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClppO88696 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClppO88696 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClppO88696 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClppO88696 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClppO88696 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClppO88696 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClppO88696 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClppO88696 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClppO88696 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClppO88696 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClppO88696 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClppO88696 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClppO88696 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClppO88696 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClppO88696 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClppO88696 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClppO88696 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClppO88696 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClppO88696 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClppO88696 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClppO88696 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClppO88696 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClppO88696 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ClppO88696 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClppO88696 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClppO88696 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClppO88696 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClppO88696 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClppO88696 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClppO88696 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClppO88696 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClppO88696 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClppO88696 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ClppO88696 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClppO88696 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClppO88696 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClppO88696 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClppO88696 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ClppO88696 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClppO88696 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClppO88696 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClppO88696 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClppO88696 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ClppO88696 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClppO88696 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClppO88696 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClppO88696 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClppO88696 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClppO88696 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClppO88696 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClppO88696 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ClppO88696 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClppO88696 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClppO88696 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClppO88696 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClppO88696 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClppO88696 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClppO88696 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClppO88696 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClppO88696 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClppO88696 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClppO88696 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClppO88696 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ClppO88696 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClppO88696 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClppO88696 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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