Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms