Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Kcnk4O88454 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Kcnk4O88454 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Kcnk4O88454 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Kcnk4O88454 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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