Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd46O88174 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd46O88174 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd46O88174 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd46O88174 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd46O88174 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd46O88174 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd46O88174 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms