Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SfnO70456 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SfnO70456 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SfnO70456 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SfnO70456 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SfnO70456 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SfnO70456 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SfnO70456 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SfnO70456 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SfnO70456 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SfnO70456 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SfnO70456 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SfnO70456 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SfnO70456 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SfnO70456 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SfnO70456 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SfnO70456 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SfnO70456 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SfnO70456 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SfnO70456 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SfnO70456 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SfnO70456 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SfnO70456 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SfnO70456 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SfnO70456 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SfnO70456 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SfnO70456 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SfnO70456 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SfnO70456 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SfnO70456 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SfnO70456 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SfnO70456 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SfnO70456 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SfnO70456 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SfnO70456 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SfnO70456 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SfnO70456 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SfnO70456 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SfnO70456 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SfnO70456 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SfnO70456 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SfnO70456 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SfnO70456 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SfnO70456 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SfnO70456 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SfnO70456 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SfnO70456 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SfnO70456 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SfnO70456 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SfnO70456 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SfnO70456 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SfnO70456 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SfnO70456 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SfnO70456 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SfnO70456 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SfnO70456 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SfnO70456 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SfnO70456 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SfnO70456 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SfnO70456 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SfnO70456 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SfnO70456 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SfnO70456 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SfnO70456 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SfnO70456 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SfnO70456 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SfnO70456 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms