Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms