Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ldb2O55203 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ldb2O55203 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ldb2O55203 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ldb2O55203 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ldb2O55203 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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