Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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ChkaO54804 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ChkaO54804 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ChkaO54804 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ChkaO54804 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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