Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffbO54788 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffbO54788 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffbO54788 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffbO54788 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffbO54788 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DffbO54788 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffbO54788 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffbO54788 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffbO54788 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffbO54788 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffbO54788 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffbO54788 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DffbO54788 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffbO54788 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffbO54788 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffbO54788 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffbO54788 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffbO54788 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffbO54788 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffbO54788 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffbO54788 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DffbO54788 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DffbO54788 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffbO54788 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffbO54788 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffbO54788 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffbO54788 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffbO54788 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffbO54788 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffbO54788 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffbO54788 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffbO54788 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffbO54788 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffbO54788 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffbO54788 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffbO54788 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffbO54788 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffbO54788 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffbO54788 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffbO54788 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffbO54788 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffbO54788 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffbO54788 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffbO54788 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffbO54788 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffbO54788 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffbO54788 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffbO54788 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffbO54788 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffbO54788 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffbO54788 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffbO54788 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffbO54788 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffbO54788 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffbO54788 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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