Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnc1O35914 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bnc1O35914 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bnc1O35914 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bnc1O35914 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bnc1O35914 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bnc1O35914 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bnc1O35914 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms