Protein–RNA interactions for Protein: O35654

Pold2, DNA polymerase delta subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold2O35654 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pold2O35654 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pold2O35654 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pold2O35654 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pold2O35654 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms