Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk2O35491 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Clk2O35491 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk2O35491 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk2O35491 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk2O35491 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Clk2O35491 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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