Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TnxbO35452 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TnxbO35452 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms