Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms