Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Dgcr6O35347 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Dgcr6O35347 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
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Dgcr6O35347 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Dgcr6O35347 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
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Dgcr6O35347 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Dgcr6O35347 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Dgcr6O35347 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Dgcr6O35347 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Dgcr6O35347 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms