Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nedd9O35177 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Nedd9O35177 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Nedd9O35177 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Nedd9O35177 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
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Nedd9O35177 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
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Nedd9O35177 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Nedd9O35177 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Nedd9O35177 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Nedd9O35177 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Nedd9O35177 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Nedd9O35177 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Nedd9O35177 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Nedd9O35177 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd9O35177 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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