Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Scarb2O35114 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Scarb2O35114 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Scarb2O35114 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Scarb2O35114 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Scarb2O35114 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Scarb2O35114 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Scarb2O35114 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Scarb2O35114 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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