Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Cldn4O35054 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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