Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra2O08842 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra2O08842 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra2O08842 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra2O08842 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra2O08842 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gfra2O08842 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra2O08842 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra2O08842 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra2O08842 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra2O08842 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra2O08842 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra2O08842 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra2O08842 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra2O08842 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra2O08842 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra2O08842 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra2O08842 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra2O08842 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra2O08842 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra2O08842 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra2O08842 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra2O08842 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra2O08842 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gfra2O08842 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra2O08842 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra2O08842 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra2O08842 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra2O08842 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra2O08842 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms