Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms