Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms