Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Gm8356J3QPD3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Gm8356J3QPD3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Gm8356J3QPD3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Gm8356J3QPD3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Gm8356J3QPD3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Gm8356J3QPD3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Gm8356J3QPD3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Gm8356J3QPD3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Gm8356J3QPD3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Gm8356J3QPD3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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