Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms