Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms