Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Top6blJ3QMY9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Top6blJ3QMY9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Top6blJ3QMY9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Top6blJ3QMY9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Top6blJ3QMY9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Top6blJ3QMY9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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