Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm3J3QMI4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms