Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Tmem200cJ3QK46 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Tmem200cJ3QK46 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Tmem200cJ3QK46 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Tmem200cJ3QK46 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Tmem200cJ3QK46 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Tmem200cJ3QK46 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmem200cJ3QK46 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmem200cJ3QK46 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmem200cJ3QK46 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmem200cJ3QK46 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmem200cJ3QK46 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmem200cJ3QK46 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmem200cJ3QK46 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem200cJ3QK46 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem200cJ3QK46 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem200cJ3QK46 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem200cJ3QK46 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem200cJ3QK46 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem200cJ3QK46 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem200cJ3QK46 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem200cJ3QK46 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem200cJ3QK46 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem200cJ3QK46 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem200cJ3QK46 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem200cJ3QK46 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem200cJ3QK46 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem200cJ3QK46 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem200cJ3QK46 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem200cJ3QK46 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem200cJ3QK46 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem200cJ3QK46 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem200cJ3QK46 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem200cJ3QK46 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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