Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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