Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AK157302I3ITR1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms