Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms