Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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